当莉洛（黛维·切斯 Daveigh Chase 配音）和史迪奇（克里斯·桑德斯 Chris Sanders 配音）终竟结束了他们的管事之后，史迪奇行将和贾巴博士（大卫·奥根·斯提尔斯 David Ogden Stiers 配音）以及普利凯利（凯文·麦克唐纳 Kevin McDonald 配音）通盘返回他们的星球，然而，就在这个节骨眼上，一个名为勒罗伊（克里斯·桑德斯 Chris Sanders 配音）的阴险试验品浮出了水面。阴谋勃勃的汉姆斯特维尔博士（杰夫·贝内特 Jeff Bennett 配音）想要将极为进犯的勒罗伊复制成为一支部队，统辖通盘寰宇。为了粉碎汉姆斯特维尔博士的阴谋，莉洛和史迪奇再度合故故，他们所要面对的，是和过去迥异的，重大而又进犯的敌人。