在雄伟泰平的原始森林中，许可的蓝精灵们正在预备一年一度的蓝月日月节。而就在这高兴辛苦碌的重要，他们的宿敌——阴险的巫师格格巫（汉克·阿扎瑞亚 Hank Azaria 饰）和他的宠物阿兹猫闯入了蓝精灵的隐衷领地。受到惊吓的蓝精灵四散而逃，此中恻隐的笨笨（安东·尤金 Anton Yelchin 配音）则盲打误撞跑进了据说曾经死遗失99个蓝精灵的瀑布进去。终竟，笨笨连同营救他的蓝爸爸、蓝妹妹、聪聪等卷入了隐藏的漩涡，来到了美国纽约的重心花坛。在这个无缺陌生的寰宇，他们赢得装饰品业的帕特里克（尼尔·帕特里克•哈里斯 Neil Patrick Harris 配音）的附和。为了返回大森林，蓝精灵们想尽种种目的。与此同期，格格巫和阿兹猫也来到纽约……