1992年，日政府在关西的筑波设立国际哥斯拉设施焦点。寰宇科技精英共聚一堂，合力钻探一部G超火器—迟钝哥斯拉。以大前博士为首的造访团达到亚度诺亚岛时，露出了一只齐备无缺的蛋。当欢聚把蛋带回宇下时飞翼龙拿顿阐述并进犯拼造访团一行人。这时哥斯拉亦在亚度诺亚岛阐述，两只怪兽由海上战斗到陆上……...